Eduardo Villnúa Ibáñez comenzó sus estudios como alumno interno de la Beneficencia Provincial de Madrid. Después de pasar cuatro meses ampliando su formación en Frankfurt en 1922, obtuvo el título de Profesor de Gimnástica por la Facultad de Medicina, con nota de sobresaliente. Para ello realizó, en 1931, un curso en la Escuela Central de Gimnasia de Toledo, única escuela oficial de esta materia que existía en España en aquel momento. En esa época obtuvo también el título de Médico de la Marina Civil, y el título de Inspector Municipal de Sanidad.